COVID-19患者血浆刺激混合人脐静脉内皮细胞的mRNA表达谱
该数据集来自omicsdi.org，主题为转录组学，属于呼吸系统疾病/其他分类。研究对混合人脐静脉内皮细胞给予COVID-19患者血浆刺激后进行mRNA表达谱检测，旨在识别暴露后失调的mRNA及其在血管炎症中的可能作用
基本信息
资源简介
COVID-19患者血浆刺激混合人脐静脉内皮细胞的mRNA表达谱
该数据集来自omicsdi.org，主题为转录组学，属于呼吸系统疾病/其他分类。研究对混合人脐静脉内皮细胞给予COVID-19患者血浆刺激后进行mRNA表达谱检测，旨在识别暴露后失调的mRNA及其在血管炎症中的可能作用。源站描述还提及一项多中心回顾性纵向队列研究，纳入142例实验室确诊SARS-CoV-2感染患者、27例轻症上呼吸道症状患者及69例ICU的SARS-CoV-2阴性患者，并涉及基因调控网络评估、基因集富集分析和体外通透性随访。数据可用于探索COVID-19相关内皮功能障碍与血管炎症的转录组特征（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究的目的是识别暴露于COVID-19患者血浆后失调的mRNA，这些mRNA可能参与血管炎症。因此，我们开展了一项多中心、回顾性纵向队列研究，纳入142例实验室确诊SARS-CoV-2感染患者，他们于2020年5月至2020年12月期间就诊于两家加拿大医院，同时纳入27例有轻度上呼吸道症状的SARS-CoV-2患者和69例来自ICU的SARS-CoV-2阴性患者。对SARS-CoV-2阳性患者的血液在急诊科（轻度）、病房（中度）或重症监护室（重度）进行生物样本库保存。基因调控网络评估、基因集富集分析和体外通透性随访提示连接蛋白表达的功能性降低。此后，证实了VE-cadherin的严重降低
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE178331
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE178331
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在识别暴露于COVID-19患者血浆后失调的mRNA，这些mRNA可能参与血管炎症的发生。为此，我们开展了一项多中心、回顾性纵向队列研究，纳入2020年5月至2020年12月期间就诊于两家加拿大医院的142例实验室确诊SARS-CoV-2感染患者，同时纳入27例伴有轻度上呼吸道症状的SARS-CoV-2患者以及69例来自ICU的SARS-CoV-2阴性患者。对SARS-CoV-2阳性患者在急诊科（轻症）、病房（中症）或重症监护室（重症）进行血液生物样本库储存。基因调控网络评估、基因集富集分析以及体外通透性后续研究提示连接蛋白表达存在功能性降低。此后，证实VE-钙黏蛋白和ZO-1存在关键性降低，这可能驱动COVID-19中症和重症病例的病理过程。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
