Lung NR3C1+ 与 CXCR6 高表达 CD4 T 细胞区分人肺气肿免疫发病机制

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE302339

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在吸烟的慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者中，T细胞如何促进肺气肿的发生存在显著的知识空白。对人类样本进行单细胞RNA测序（scRNA seq）分析并结合相关临床数据，可为疾病发病机制提供新的见解。我们构建了一个内部的人类肺部scRNA seq数据集，并附有详尽的疾病特征注释，同时分析了另一个独立的scRNA seq数据集，以探究T细胞在肺气肿中的病理生理作用。对肺气肿型（E）-COPD、非肺气肿型（NE）-COPD和对照组肺部免疫景观的比较显示，E-COPD中T细胞呈正向富集。通路分析发现，CD4 T细胞中炎症状态的上调是E-COPD的一个显著特征。与对照组相比，表达糖皮质激素受体NR3C1的CD4 T细胞在NE-COPD中富集，但在E-COPD中减少。在E-COPD中，通过CXCL信号通路介导的巨噬细胞与NR3C1+ CD4 T细胞亚群之间的相互作用被强烈预测，而在NE-COPD和对照组中则不存在。

在E-COPD中，CD4 CXCR6高表达效应记忆T细胞的相对丰度与保留的肺功能呈正相关，而在NE-COPD中则不然。总体而言，这些发现表明，CD4 T细胞的NR3C1+和CXCR6高表达效应记忆亚群能够区分人肺气肿的免疫病理生理特征。针对肺气肿中相关T细胞亚群的分子靶向治疗可能提供新的治疗机会。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。