LLaVA-Rad MIMIC-CXR 标注集

该数据集提供了由 GPT-4 从 MIMIC-CXR 中提取的放射学报告章节,通过纳入更多包含“发现”的报告来补充基于规则的章节提取,并移除了“发现”中对既往检查的引用

physionet
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医学影像胸部X线放射报告医学文本呼吸系统信息抽取章节提取文本标注报告解析
LLaVA-Rad MIMIC-CXR Annotations

基本信息

模态
医学影像
许可
PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
创建/更新时间
2026-10-01
版本
1.0.0

资源简介

LLaVA-Rad MIMIC-CXR 标注集

该数据集提供了由 GPT-4 从 MIMIC-CXR 中提取的放射学报告章节,通过纳入更多包含“发现”的报告来补充基于规则的章节提取,并移除了“发现”中对既往检查的引用

llava-rad-mimic-cxr-annotation

【数据集背景】

本数据集源站标题为《LLaVA-Rad MIMIC-CXR Annotations》。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集提供了由 GPT-4 从 MIMIC-CXR 中提取的放射学报告章节,通过纳入更多包含“发现”的报告来补充基于规则的章节提取,并移除了“发现”中对既往检查的引用。

【主题与分类】

主题标签:胸部X线、放射报告、医学文本、呼吸系统、信息抽取、章节提取、文本标注、报告解析。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://physionet.org/content/llava-rad-mimic-cxr-annotation/

使用许可:PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0。

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使用方式

数据集获取(PhysioNet)

PhysioNet 数据需注册账号(机构邮箱)并签署数据使用协议后下载:

  1. 在 https://physionet.org/content/llava-rad-mimic-cxr-annotation/1.0.0 页面登录并接受许可条款;
  2. 命令行整目录下载:
wget -r -N -c -np --user=<账号> --ask-password https://physionet.org/files/llava-rad-mimic-cxr-annotation/1.0.0/
  1. 或用官方工具(推荐,支持断点续传与校验):
pip install physionet-download
physionet-download llava-rad-mimic-cxr-annotation

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

其特点是能够从 MIMIC-CXR 自由文本放射学报告中更准确地提取章节。传统上,人们使用基于规则的方法提取检查原因、所见和印象等章节。然而,由于报告结构和临床语言的不一致,这些方法常常失败。在本研究中,我们利用 GPT-4 更可靠地提取这些章节,向训练划分添加了 237,073 个图像-文本对,向验证划分添加了 1,952 个图像-文本对。这一改进促成了 LLaVA-Rad 的开发和微调;LLaVA-Rad 是专为放射学应用定制的多模态大语言模型(LLM),在报告生成任务上取得了更好的性能。

许可

PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0

引用

学术使用请引用:{Zambrano Chaves et al. (2025). LLaVA-Rad MIMIC-CXR Annotations. PhysioNet. doi:10.13026/4ma4-k740 DOI 10.13026/4ma4-k740。

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