LD-REIMS揭示次氯酸应激对铜绿假单胞菌PQS群体感应的直接影响

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000093056

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了在人类宿主中建立感染，铜绿假单胞菌必须克服先天免疫产生的氧化应激，例如中性粒细胞产生的次氯酸（HOCl）。我们着手寻找氧化应激的特异性代谢组学生物标志物，并开发了一种方案，利用一种新型质谱电离技术——激光解吸快速蒸发电离质谱（LD-REIMS），对不同氧化剂存在下培养的铜绿假单胞菌培养物进行代谢谱分析。我们证明LD-REIMS能够以100%的准确率将样品分类为未处理或用特定氧化剂处理，并鉴定出一组54种代谢物，其在暴露于一种或多种氧化剂后浓度发生显著改变。关键代谢变化在从囊性纤维化肺部感染患者中分离的铜绿假单胞菌临床菌株中得以保守。这些数据表明，HOCl应激影响了假单胞菌喹诺酮信号（PQS）群体感应系统。在受HOCl应激的铜绿假单胞菌中，与PQS系统相关的十种2-烷基-4-喹诺酮（AHQs）的浓度显著降低。

铜绿假单胞菌培养物，包括2-庚基-3-羟基-4(1H)-喹诺酮（PQS），这是PQS系统中最活跃的信号分子。PQS系统调控毒力因子的产生，包括绿脓菌素和弹性蛋白酶，而这些毒力因子的水平受到HOCl应激的显著影响。在亚致死浓度HOCl下生长的培养物中，未检测到绿脓菌素，且弹性蛋白酶浓度显著降低，这表明这种中性粒细胞来源的氧化剂可能通过干扰PQS相关毒力因子的产生，破坏铜绿假单胞菌建立感染的能力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。