COPD戒烟者诱导痰基因与肺功能及影像学疾病严重程度关联数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-22148

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

诱导痰用于采集COPD患者气道中的炎症细胞，主要是中性粒细胞和巨噬细胞。我们的目标是通过表达谱分析识别与气流阻塞程度和肺气肿范围相关的候选基因，然后使用特异性PCR和蛋白质分析对选定候选基因的这些发现进行验证。在ECLIPSE队列的GOLD 2-4期COPD戒烟者中进行了两项痰液研究。首先，在1480名患者的基线时进行了基因芯片表达谱分析。在第1年，使用来自另一176名患者群体的样本进行实时PCR。IL-18R的基因表达发现进一步通过免疫组化在ECLIPSE队列之外患者的肺组织和诱导痰样本中进行了分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。