囊性纤维化肺部感染铜绿假单胞菌种群中脂多糖突变体与R2-绿脓菌素敏感变异体的高流行率

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.x3ffbg7r6

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数据集大小约 28.3 KB。

数据说明

囊性纤维化（CF）肺部的慢性、高度耐药感染导致发病率和死亡率不断上升。铜绿假单胞菌是CF常见的病原体，对多种抗生素表现出耐药性，加剧了抗菌药物耐药性（AMR）。这些细菌群体表现出遗传和表型多样性，但这种多样性如何影响其对细菌素的敏感性尚不清楚。R-绿脓菌素，即铜绿假单胞菌产生的细菌素，是一类噬菌体尾样抗菌物质。R-绿脓菌素具有作为抗菌药物的潜力，然而，近期研究表明，CF肺部感染中铜绿假单胞菌变体的多样性导致其对R-绿脓菌素的敏感性存在差异。这种差异可能与脂多糖（LPS）的变化有关，LPS作为R-绿脓菌素的受体。目前，尚不清楚在慢性CF肺部感染中R-绿脓菌素敏感菌株的出现频率，尤其是考虑到这些菌株内部的异质性时。在本研究中，我们对来自7名CF患者17份痰样本的139个铜绿假单胞菌变体进行了R2-绿脓菌素敏感性测试，并分析了LPS表型。

我们发现，83%的痰样本中不存在R2-绿脓菌素耐药变异体，而几乎所有样本都含有敏感变异体。LPS表型与R2-绿脓菌素敏感性之间没有相关性，尽管我们估计约76%的痰源变异体缺乏O特异性抗原，40%缺乏共同抗原，24%具有改变的LPS核心。LPS表型与R-绿脓菌素敏感性之间缺乏相关性表明，LPS包装密度可能在CF变异体对R-绿脓菌素的敏感性中起重要作用。我们的研究支持R-绿脓菌素作为治疗剂的潜力，因为许多感染性CF变异体对R2-绿脓菌素敏感，即使在多样化的细菌群体中也是如此。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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