皮肌炎皮肤中的干扰素和生物学特征：疾病间的特异性和异质性

资源简介

皮肌炎皮肤中的干扰素和生物学特征：疾病间的特异性和异质性

【一句话概览】

分析皮肌炎（DM）皮肤全基因组表达数据并与健康对照比较，发现DM皮肤中干扰素（IFN）诱导基因显著上调，并涉及炎症、补体激活及表皮活化与分化等基因模块。该IFN特征不仅见于DM和狼疮，也见于皮肤单纯疱疹-2型感染，在银屑病中程度较轻，而在特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、寻常痤疮、系统性硬化症及局限性硬皮病中缺失或微弱。基于体外IFN刺激表达特征，DM皮肤的IFN特征似更接近I型而非II型IFN，但DM皮肤中多数已知I型IFN及IFN-γ均过表达，且IFN-β与IFN-γ转录水平与体内IFN转录反应程度高度相关（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Interferon and Biologic Signatures in Dermatomyositis Skin: Specificity and Heterogeneity across Diseases》。配套论文《Interferon and Biologic Signatures in Dermatomyositis Skin: Specificity and Heterogeneity across Diseases》发表于 PLoS ONE（2012），DOI：10.1371/journal.pone.0029161。源站首次发布：2012-01-03。

【数据内容】

源站原始描述：Background Dermatomyositis (DM) is an autoimmune disease that mainly affects the skin, muscle, and lung. The pathogenesis of skin inflammation in DM is not well understood. Methodology and Findings We analyzed genome-wide expression data in DM skin and compared them to those from healthy controls. We observed a robust upregulation of interferon (IFN)-inducible genes in DM skin, as well as several other gene modules pertaining to inflammation, complement activation, and epidermal activation and d…

中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：背景 皮肌炎（DM）是一种主要累及皮肤、肌肉和肺的自身免疫性疾病。DM中皮肤炎症的发病机制尚不清楚。 方法与发现 我们分析了DM皮肤中的全基因组表达数据，并将其与健康对照的数据进行了比较。我们观察到DM皮肤中干扰素（IFN）诱导基因的显著上调，以及与炎症、补体激活和表皮活化与分化相关的其他几个基因模块。DM特征中的干扰素（IFN）诱导基因不仅存在于DM和狼疮中，也存在于皮肤单纯疱疹-2型感染中，并在较小程度上存在于银屑病中。这种IFN特征在特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、寻常痤疮、系统性硬化症和局限性硬皮病/莫尔菲亚中缺失或微弱存在。基于体外IFN刺激表达特征，我们观察到DM皮肤中的IFN特征似乎与I型IFN的关系比与II型IFN更密切。然而，对DM皮肤中IFN mRNA的定量显示，大多数已知的I型IFN以及IFN γ在DM皮肤中过表达。此外，IFN-β和IFN-γ（而非其他I型IFN）的转录水平与DM皮肤中体内IFN转录反应的程度高度相关。 结论与意义 与血液和肌肉一样，DM皮肤的特征是IFN特征的压倒性存在，尽管很难最终将这种反应定义为I型或II型。通过鉴定既产生IFN又对IFN作出反应的细胞的性质，以及每种病变组织中具有生物学活性的IFN亚型，将有助于进一步理解IFN特征在这一广泛炎症性疾病中的意义。

【数据结构与技术规格】

文件数 9 个，合计 7.72 MB。Figure_S1.tif：image/tiff，675.08 KB。Figure_S2.tif：image/tiff，2.48 MB。Figure_S3.tif：image/tiff，1.68 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0029161。

【主题与分类】

源站学科分类：Developmental Biology、Immunology、Physiology、Biological Sciences、Genetics。主题标签：interferon、biologic、signatures、dermatomyositis、specificity、heterogeneity、diseases。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Developmental Biology、Immunology、Physiology、Biological Sciences、Genetics。

【获取与许可】

源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Interferon_and_Biologic_Signatures_in_Dermatomyositis_Skin_Specificity_and_Heterogeneity_across_Diseases/130031

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Wong, David; Kea, Bory; Pesich, Rob; W. Higgs, Brandon; Zhu, Wei; Brown, Patrick; et al. (2016). Interferon and Biologic Signatures in Dermatomyositis Skin: Specificity and Heterogeneity across Diseases. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。