南非儿童HBV感染与免疫血清学标志物数据集

该数据集来自南非金伯利的COSAC研究,包含174名HIV阴性儿童(经KReC招募,2014年7月至2016年8月因呼吸道感染住院)和136名HIV阳性儿童(主要来自HIV门诊,2009年9月至2016年7月招募),年龄6-60个月

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2023-06-01 更新
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其他分类hepatitis b virusHBVvaccineimmunologyantibodiesserologyHIVSouth AfricaepidemiologyMedical Infection Agents (incl. Prions)Medical Virology
Hepatitis B virus (HBV): serological markers of infection and immunity in a cohort of South African children

基本信息

模态
其他
大小
0.000244688 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

南非儿童HBV感染与免疫血清学标志物数据集

Hepatitis B virus (HBV): serological markers of infection and immunity in a cohort of South African children

该数据集来自南非金伯利的COSAC研究,包含174名HIV阴性儿童(经KReC招募,2014年7月至2016年8月因呼吸道感染住院)和136名HIV阳性儿童(主要来自HIV门诊,2009年9月至2016年7月招募),年龄6-60个月。所有儿童在研究采血时同步进行常规临床采血,样本检测HBV感染与免疫标志物,包括HBsAg、anti-HBs和anti-HBc等。数据文件包括疫苗应答数据表和队列特征表,可用于分析HIV暴露与感染背景下儿童HBV血清学模式、疫苗免疫应答及相关流行病学研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《HBV vaccination and PMTCT as elimination tools in the presence of HIV: insights from a clinical cohort and dynamic model》发表于 期刊(2017),DOI:10.1101/162594。项目资助方:Rosetrees Trust and Wellcome Trust Intermediate Clinical Fellowship (Philippa Matthews)。源站首次发布:2018-02-07。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):年龄6-60个月的儿童作为南非儿童共感染(COSAC)研究的一部分在南非金伯利招募。HIV阴性参与者(n=174)通过金伯利呼吸道队列(KReC)招募。这些儿童于2014年7月至2016年8月期间因临床诊断为呼吸道感染而入院。HIV阳性儿童(n=136)主要从HIV门诊招募(招募时间为2009年9月至2016年7月)。儿童在研究采血时同步进行常规临床血液检测。我们检测了所有样本的乙型肝炎病毒(HBV)感染和免疫标志物。HBsAg检测在南非金伯利医院使用磁性颗粒化学发光免疫分析法(MPCI;Advia Centaur平台)进行。确证性HBsAg检测,连同anti-HBs和anti-HBc检测

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 244.69 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.5601679.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medical infection agents (incl. prions)、Medical virology。主题标签:hepatitis b virus、HBV、vaccine、immunology、antibodies、serology、HIV、South Africa、epidemiology、Medical Infection Agents (incl. Prions)。本站分类:呼吸系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medical infection agents (incl. prions)、Medical virology。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Hepatitis_B_virus_HBV_serological_markers_of_infection_and_immunity_in_a_cohort_of_South_African_children/5601679

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Hattingh, Louise; van Zyl, Anriette; Daniels, Samantha; Adland, Emily; McNaughton, Anna; Jeffery, Katie; et al. (2018). Hepatitis B virus (HBV): serological markers of infection and immunity in a cohort of South African children. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 244.7 KB。

数据说明

作为南非儿童共感染(COSAC)研究的一部分,我们在南非金伯利招募了6-60月龄儿童。HIV阴性参与者(n=174)通过金伯利呼吸道队列(KReC)招募。这些儿童于2014年7月至2016年8月期间因临床诊断为呼吸道感染而入院。HIV阳性儿童(n=136)主要从HIV门诊诊所招募(招募时间为2009年9月至2016年7月)。儿童在研究采血时同步进行常规临床血液检测。我们对所有样本进行了乙型肝炎病毒(HBV)感染及免疫标志物检测。HBsAg检测在南非金伯利医院采用磁微粒化学发光免疫分析法(MPCI;Advia Centaur平台)进行。确证性HBsAg检测以及抗-HBs和抗-HBc检测由英国牛津大学医院(OUH)NHS基金会信托微生物学部门完成(Architect i2000)。

本研究已获得南非布隆方丹自由州大学健康科学学院伦理委员会的伦理批准(HIV研究参考号:ETOVS Nr 08/09;COSAC研究参考号:ECUFS NR 80/2014)。儿童父母或监护人已签署书面知情同意书,同意其子女纳入本研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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