GSE93898：MMP28是肺气肿发病机制的关键贡献者

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93898

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数据说明

慢性阻塞性肺疾病由慢性支气管炎和肺气肿组成，是发病和死亡的主要原因。由于组织破坏是肺气肿的显著特征，细胞外蛋白酶，尤其是具有弹性蛋白溶解能力的蛋白酶，常被认为是该疾病的关键驱动因素。多项人类和小鼠研究已表明基质金属蛋白酶（MMPs），特别是巨噬细胞来源的蛋白酶，在COPD发病机制中发挥作用。MMP28由肺上皮和巨噬细胞表达，我们发现它调节巨噬细胞的募集和极化。我们假设MMP28会通过改变巨噬细胞数量和活化在肺气肿中发挥促进作用。鉴于肺气肿发病机制与巨噬细胞涌入之间的既定关联，我们评估了暴露于3个月和6个月香烟烟雾的Mmp28-/-小鼠的炎症变化和肺组织学。在较早的时间点，我们发现烟雾暴露的Mmp28-/-肺中巨噬细胞极化发生改变，这与MMP28调节巨噬细胞活化的其他已发表发现一致。

在3个月和6个月时，Mmp28-/-小鼠的炎症反应减弱，更接近于未吸烟小鼠，中性粒细胞募集和CXCL1趋化因子表达减少。到6个月时，Mmp28-/-小鼠免于发生肺气肿。这些结果突显了MMP28在促进香烟烟雾诱导的慢性肺部炎症和组织重塑中一个此前未被认识的作用，并指出了另一个调节COPD的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。