无毒与强毒Plasmodium chabaudi chabaudi感染急性期全血转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93631

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

对感染无毒力伯氏疟原虫AS株或强毒力CB株的小鼠在感染急性期全程采集的血液样本进行分析

寄生虫遗传因素对免疫应答及疟疾严重病理发展的影响在很大程度上尚不清楚。本研究对两种毒力不同的啮齿类疟疾寄生虫——伯氏疟原虫——在血液期感染期间的全血进行了全基因组转录组分析。我们鉴定出若干与强毒力感染相关的转录组特征，包括肺部炎症、更严重且持续时间更长的贫血以及血小板聚集等特征。后两种特征在病理出现之前即可检测到。贫血特征表明宿主红细胞生成失调，而肺部炎症特征则与中性粒细胞浸润增加、细胞死亡增多以及肺部寄生虫隔离增强相关。这种对强毒力和无毒力疟疾感染进行比较的全血转录组分析表明，该方法可有效反映疟疾感染的严重程度，并为致病机制提供见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。