PIZ小鼠肝脏中无ATZ小球与含ATZ小球肝细胞的差异基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE84763

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

α1-抗胰蛋白酶缺乏症是一种累及肝脏和肺的疾病，其中错误折叠的ATZ蛋白积聚形成大的蛋白聚集体或小球，导致显著的细胞应激。从出生至2月龄，几乎每个肝细胞都含有大量突变ATZ蛋白小球。在2月龄时，出现无小球肝细胞的小集落，随着时间推移，肝脏大部分变为无小球状态。本分析旨在鉴定无小球细胞与含小球细胞之间的差异基因表达谱，以识别调控突变ATZ蛋白清除的关键因子和通路。我们使用激光捕获显微切割技术从无ATZ小球肝细胞和含ATZ小球肝细胞中分离RNA，并对其进行微阵列分析，以详细描绘差异全局基因表达谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。