Act-mOVA/OT-I模型急性移植物抗宿主病中的CD8+ T细胞应答

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE79083

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

接受来自C57Bl/6 OT-I动物的异基因造血干细胞移植（aHSCT）的致死性照射C57Bl/6 Act-mOVA小鼠，以CD8+ T细胞依赖性、可重复的方式发生急性移植物抗宿主病（aGvHD），并在4-7天内死于该病。追踪UBC-GFP/OT-I移植物CD8+ T细胞显示，在疾病发作时，胃肠道、肝脏和肺部有大量浸润，并具有急性胃肠道和肝脏GvHD以及aGVHD相关淋巴细胞性支气管炎的特征性组织学表现。本数据集描述了从移植前（aHSCT + 第0天）的移植物中以及将移植物植入Act-mOVA受体后（aHSCT + 第4天）从宿主各靶器官中回收的CD45.1/OT-1 CD8+ T细胞的基因表达模式。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。