人支气管上皮细胞第3代与第0代表达谱

该数据集来自 NCBI GEO,包含人支气管上皮细胞第3代与第0代的基因表达谱比较,共1个文件(GSE7557_series_matrix.txt.gz),基于GPL5102平台、物种9606

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL51029606
GSE7557: Human bronchial epithelial cells_Passage 3 vs. passage 0

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

人支气管上皮细胞第3代与第0代表达谱

Human bronchial epithelial cells_Passage 3 vs. passage 0

该数据集来自 NCBI GEO,包含人支气管上皮细胞第3代与第0代的基因表达谱比较,共1个文件(GSE7557_series_matrix.txt.gz),基于GPL5102平台、物种9606。数据可用于研究支气管上皮细胞传代过程中的表达变化,并与鳞状化生、COPD气道重塑及上皮-间质相互作用等机制关联分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 19 200。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):鳞状化生常见于吸烟者,并与慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的气道阻塞相关。COPD气道阻塞的主要机制是小气道壁增厚。我们试图探究鳞状化生是否通过改变COPD中上皮-间质相互作用而主动促进气道壁增厚。利用免疫组化染色、气道形态计量学和COPD患者肺样本的成纤维细胞培养、鳞状化生模型的全基因组分析以及人气道上皮-间质相互作用的体外建模,我们提供了证据表明鳞状化生通过增加IL-1分泌诱导邻近气道成纤维细胞的纤维化反应。我们确定了整合素介导的TGF-b激活在放大鳞状化生和驱动IL-1依赖性促

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL5102、9606。本站分类:呼吸系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7557

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 18 201,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

鳞状化生在吸烟者中很常见,并与慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的气道阻塞相关。COPD气道阻塞的主要机制是小气道壁增厚。我们探讨了鳞状化生是否通过改变COPD中上皮-间质相互作用而主动促进气道壁增厚。利用免疫组化染色、气道形态计量学和COPD患者肺样本的成纤维细胞培养、鳞状化生模型的全基因组分析以及人气道上皮-间质相互作用的体外建模,我们提供了证据表明鳞状化生通过增加IL-1分泌诱导邻近气道成纤维细胞的纤维化反应。我们确定了整合素介导的TGF-b激活在放大鳞状化生和驱动IL-1依赖性促纤维化间质反应中的关键作用。

最后,我们表明鳞状化生与COPD严重程度增加相关,而成纤维细胞整合素avb8的表达——它是气道成纤维细胞TGF-b活化的主要介导者——与COPD的疾病严重程度和小气道壁增厚相关。关键词:全基因组差异表达研究

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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