MHC I类抗体诱导小鼠闭塞性气道疾病基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE71426

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为进一步理解抗体介导的肺部慢性炎症中的早期分子事件，我们利用了一种小鼠天然肺的闭塞性气道疾病（OAD）模型，其中针对MHC I类分子的抗体可诱导细支气管闭塞和纤维化。本研究发现了一个独特的转录谱，与同型对照处理的肺相比，抗MHC I处理的肺中有一组基因受到刺激，而另一组基因则被抑制。肺移植（LTx）是治疗各种难治性肺功能障碍的一种公认临床干预手段。然而，针对错配供体HLA的新生抗体（DSA）使肺移植物易发生慢性排斥反应，即闭塞性细支气管炎综合征（BOS）。抗MHC诱导的小鼠OAD模型是研究MHC连接后早期发病机制的唯一可用临床前模型，其产生的病变与BOS类似。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。