GSE63073：与肺气肿相关的基因在泛素化通路中富集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE63073

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小气道阻力增加和肺弹性下降是慢性阻塞性肺疾病（COPD）气流受限的重要原因。与肺弹性丧失相对应的病变是肺气肿；小气道阻塞则源于炎症性狭窄和闭塞。尽管它们在生理改变上趋于一致，但不同机制参与了这些过程。基因表达与这些特定表型之间的关系可能比与肺功能的比较更具揭示性。我们测量了43名吸烟者肺组织中肺泡表面积与肺体积之比（SA/V）。对21名受试者的两份样本（其SA/V差异>49 cm²/mL）进行了分析，以筛选表达与SA/V相关的基因。181个转录本的表达水平与SA/V相关（p<0.05）。在其余22名受试者中测试了这些转录本的表达与SA/V之间的关系，作为重复验证。181个基因中有30个仍与SA/V显著相关（P<0.05），且164/181个基因的关联方向一致。

通路和网络分析显示，参与蛋白质泛素化的基因富集，蛋白质印迹实验表明，在梗阻个体中参与蛋白质泛素化的基因表达发生改变。这些数据提示，修饰后的蛋白质泛素化和降解可能是肺气肿发病机制中的一个重要通路。本研究原始数据不可获取。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。