脂多糖诱导人肺微血管内皮细胞基因表达随时间变化数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE5883

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血管内皮可能在应对感染因子以及导致毛细血管渗漏的疾病过程（如感染性休克和急性呼吸窘迫综合征）的病理生理中发挥作用。为了研究内毒素对内皮细胞功能的影响，将培养的人肺微血管内皮细胞暴露于10 ng脂多糖（LPS）4、8或24小时，并使用Affymetrix HG U133plus2基因芯片研究mRNA表达的变化。主成分分析显示，LPS处理是数据变异的主要来源。LPS处理内皮细胞4、8或24小时分别导致275、260和141个基因上调两倍或以上。LPS处理在4、8或24小时分别导致176、263和79个基因下调50%或以上。在4或8小时上调的基因富集于编码细胞因子、分泌蛋白、细胞膜蛋白以及控制信号转导和转录调控的蛋白的基因。

在每个时间点下调的基因包括编码细胞膜蛋白、转录调控和代谢的基因。在每个时间点，被识别为发生变化的基因中，有显著比例是该时间点所独有的。关键词：时间进程

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。