ATCC46645菌株与ΔpacC烟曲霉突变体小鼠感染转录谱
该数据集来自 NCBI GEO(GSE54810),对 ATCC46645 烟曲霉菌株及其同源 ΔpacC 突变体在小鼠感染过程中的转录谱进行芯片表达谱分析,仅含 1 个文件(GSE54810_series_matrix.txt.gz)

基本信息
资源简介
ATCC46645菌株与ΔpacC烟曲霉突变体小鼠感染转录谱
Transcriptional profiling of ATCC46645 strain and isogenic ΔpacC Aspergillus fumigatus mutant during murine infection
该数据集来自 NCBI GEO(GSE54810),对 ATCC46645 烟曲霉菌株及其同源 ΔpacC 突变体在小鼠感染过程中的转录谱进行芯片表达谱分析,仅含 1 个文件(GSE54810_series_matrix.txt.gz)。数据可用于比较野生型与 PacC 缺失突变体在宿主肺部感染条件下的基因表达差异,研究 pH 响应转录因子 PacC 对分泌蛋白酶表达、上皮侵袭、致病性及真菌细胞壁重塑的调控作用,为肺曲霉病宿主损伤机制研究提供表达谱资源(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 10 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在由主要霉菌病原体烟曲霉引起的肺部疾病中,肺上皮被真菌菌丝的侵袭性生长破坏,这一过程被认为需要真菌蛋白酶。本研究表明,烟曲霉的 pH 响应转录因子 PacC 在侵袭性肺部感染期间调控分泌蛋白酶的表达,并且是上皮侵袭和致病性所必需的。此外,烟曲霉 ΔpacC 突变体在感染期间异常重塑真菌细胞壁。本研究定义了肺曲霉病期间由 PacC 介导的宿主损伤的不同机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10341、746128。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54810
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 21 201,引用时请注意版本时效。
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数据说明
在由主要霉菌病原体烟曲霉引起的肺部疾病中,肺上皮被真菌菌丝的侵袭性生长所破坏,这一过程被认为需要真菌蛋白酶。本研究表明,烟曲霉的pH响应转录因子PacC在侵袭性肺部感染期间调控分泌型蛋白酶的表达,并且是上皮侵袭和致病性所必需的。此外,烟曲霉ΔpacC突变体在感染过程中异常重塑真菌细胞壁。本研究明确了肺曲霉病期间由PacC介导的宿主损伤的不同机制。第1章:治疗方案
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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