miR-223过表达肺上皮细胞系与对照细胞系的差异基因调控数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE47625

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数据说明

急性肺损伤（ALI）的特征是在非心源性肺水肿背景下发生急性呼吸衰竭，导致患者出现急性呼吸窘迫综合征（ARDS），并显著增加危重症患者的死亡率。我们研究的主要目标是阐明miRNAs在肺部炎症过程中中性粒细胞-上皮细胞通讯中的作用，从而确定治疗急性肺损伤（ALI）的新靶点。在我们的研究中，我们发现了ALI过程中一种依赖miR-223的中性粒细胞-上皮细胞串扰。在ALI期间，活化的中性粒细胞（PMN）与肺上皮细胞在空间上紧密接触。此外，由于先前的研究已提示炎症细胞依赖性释放含miRNA的微囊泡可能作为从供体细胞向靶细胞交换遗传信息的一种方式，我们在实验性共培养体系中评估了PMN引起的肺上皮细胞miRNA表达改变。

该方法提供了一种选择性且极其稳健的读数：其他miRNA的表达未发生改变或仅中度改变，而肺上皮表达的miR-223在共孵育4或6小时后被显著诱导。进一步的体外和体内研究明确表明，上皮miR-223的增加并非由于miR-223的转录诱导，而是依赖于PMN，并由miR-223从PMN穿梭至肺上皮细胞所致。为探讨miR-223依赖性中性粒细胞-上皮细胞串扰在ALI中的功能作用，我们将小鼠暴露于呼吸机诱导的ALI，观察到ALI期间肺部miR-223的强烈诱导，而在抗体清除PMN后，miR-223的增加被完全消除。此外，对从ALI小鼠分离的肺泡上皮细胞的研究显示miR-223显著增加，表明在体内ALI期间miR-223从PMN穿梭至肺泡上皮。功能研究重

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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