细胞壁缺陷型人型支原体抑制尿路致病性大肠杆菌生物膜形成

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE43376

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数据说明

支原体在人肺和泌尿道等器官中的特征仍不明确。本文研究了人型支原体(M. hominis)对尿路致病性大肠杆菌(UPEC)菌株CFT073生物膜形成的作用。尽管推测人型支原体不影响UPEC的细菌适应性，包括生长以及自诱导物-2(AI-2)和吲哚等信号分子的产生，但我们发现人型支原体的存在显著降低了UPEC CFT073的生物膜形成，并轻微抑制了其黏附和细胞毒性。重要的是，该活性特异性地作用于UPEC菌株，而非存在于肠道的肠出血性大肠杆菌(EHEC)菌株。全转录组分析和定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)分析显示，PhoPQ系统和抗终止蛋白(由ybcQ编码)参与人型支原体对生物膜形成的减少(经qRT-PCR证实)。此外，结合先前关于毒素-抗毒素(TA)系统参与生物膜形成的报道，M.

在人型支原体存在下，毒素基因的转录水平升高，包括hha（Hha-TomB TA系统中的毒素基因）和pasT（PasT-PasI TA系统中的毒素部分）。因此，我们提出人型支原体可能的作用之一是影响泌尿道中细菌生物膜的形成。在尿路致病性大肠杆菌（UPEC）生物膜细胞中，人型支原体的存在仅诱导了14个基因（2.5倍）。在上调基因中，ybcQ（编码抗终止蛋白Q同源物）和phoP/phoQ（编码双组分调控系统中的DNA结合反应调节因子）受人型支原体存在的诱导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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