2009年pandemic H1N1流感感染小鼠、猕猴和猪急性宿主反应比较转录组分析（猪数据集）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE40847

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：2009年甲型H1N1流感病毒源于猪，并迅速成为全球重大的健康威胁。在小鼠、非人灵长类动物和猪的感染模型中，pH1N1病毒能在肺部高效复制并诱导促炎性宿主反应；然而，不同独立感染模型中pH1N1病毒所影响的细胞通路是否相似或不同，仍有待进一步明确。为此，我们对小鼠、猕猴和猪肺部针对单一pH1N1流感病毒A/California/04/2009（CA04）的急性宿主反应进行了比较转录组学分析。结果：尽管临床病程相似，但我们观察到所有三个物种中引发的炎症分子及其基因表达变化动力学存在差异。控制促炎和代谢过程的维甲酸X受体（RXR）信号通路在各物种感染期间受到差异性调控，尽管各物种中异二聚体RXR伙伴、通路相关信号分子及基因表达模式有所不同。

Conclusions: By comparing transcriptional changes in the context of clinical and virological measures, we identified differences in the host transcriptional response to pH1N1 virus across independent models of acute infection. Antiviral resistance and the emergence of new influenza viruses have placed more focus on developing drugs that target the immune system. Underlying overt clinical disease are molecular events that suggest therapeutic targets identified in one host may not be appropriate in another.

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。