表面活性蛋白C敲除数据集
该数据集来自 NCBI GEO，标题为 Surfactant Protein C knockout，用于研究表面活性蛋白 C 在先天肺防御中的作用
基本信息
资源简介
表面活性蛋白C敲除数据集
GSE35989 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集，标题为 Surfactant Protein C knockout，中文可译为“表面活性蛋白 C 敲除”。该数据集围绕表面活性蛋白 C 在先天肺防御中的作用展开研究，属于呼吸系统疾病相关分类下的其他类别。数据集由 Stephan、Glasser 提交，发布时间为 201 年 2 月 21 日，共包含 1 个数据文件，样例文件名为 GSE35989_series_matrix.txt.gz。整体来看，该数据集以表达谱芯片为技术手段，面向肺脏先天免疫防御机制的基础研究，适合关注表面活性蛋白 C 功能、肺部免疫以及相关呼吸系统疾病的研究者参考使用。
【数据集背景】
表面活性蛋白 C 是肺表面活性物质的重要组成成分，在维持肺泡表面张力、参与肺部先天免疫防御等方面具有研究价值。该数据集以“Surfactant Protein C knockout”为主题，目的在于研究表面活性蛋白 C 在先天肺防御中的作用。源站描述明确给出了这一研究目标，说明该数据集并非泛泛的肺组织表达谱，而是围绕特定基因敲除模型展开的功能研究数据。数据集被归入呼吸系统疾病 / 其他分类，提示其与呼吸系统疾病研究领域相关，但具体疾病关联在源站描述中未作进一步说明。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE35989_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。主题标签显示其数据类型为 Expression profiling by array，即基于芯片的表达谱分析；同时标注了 GPL1261 平台和 10090 物种编号。GPL1261 与 10090 分别对应芯片平台和小鼠物种标识，表明该数据集为小鼠来源的芯片表达谱数据。除上述信息外，源站未提供样本数量、分组设计、检测基因数量等更细的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库，属于公共基因表达数据资源。数据由 Stephan、Glasser 提交，发布时间为 201 年 2 月 21 日。源站标题为 Surfactant Protein C knockout，源站描述为研究表面活性蛋白 C 在先天肺防御中的作用。关于具体的实验材料、处理方式、测序或杂交流程等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集可用于围绕表面活性蛋白 C 敲除与肺先天防御相关的表达谱分析，例如比较敲除模型与对照之间的基因表达差异、探索肺组织在表面活性蛋白 C 缺失条件下的转录响应等。其芯片表达谱属性也使其适合作为呼吸系统疾病相关基础研究的参考数据。由于源站未提供样本分组和具体实验条件，实际适用场景需结合数据文件内容进一步确认。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE35989_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于该数据集仅包含 1 个系列矩阵文件，使用时应先解压并检查矩阵中的样本标识、表达值列和注释信息，再根据研究目的进行预处理与统计分析。
【质量与限制】
该数据集仅有 1 个文件，源站未提供样本量、重复数、质控指标等信息，因此无法从现有描述判断其数据质量水平。主题标签中的平台与物种标识有助于确认数据属性，但具体芯片型号名称、探针注释完整性和归一化方法等均未说明。使用时应注意这些限制，并在分析前自行核查数据完整性与一致性。
【引用与许可】
该数据集作者为 Stephan、Glasser，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式、许可条款和使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35989
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Study the Role of Surfactant Protein C in Innate Lung Defense.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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