TGF-beta1诱导的A549细胞经osmundacetone处理的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE351288

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺纤维化的特征是细胞外基质过度沉积和肺功能进行性丧失。本研究在TGF-β1诱导的促纤维化模型中，评估了A549肺泡上皮细胞对天然化合物紫萁丙酮（osmundacetone，OSMA）的转录反应。对溶剂对照组、TGF-β1模型组和TGF-β1加OSMA组进行了RNA测序，每组设三个生物学重复。TGF-β1在细胞外基质组织、TGF-β/SMAD信号传导、细胞因子-受体相互作用以及氧化应激程序等方面诱导了广泛变化，而OSMA使这些表达模式向对照状态转变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。