SGK1介导TGF-β1诱导的实验性闭塞性细支气管炎上皮-间质转化与纤维化[SGK]
该数据集来自NCBI GEO,围绕SGK1在肺移植后闭塞性细支气管炎(BO)纤维化中的作用,包含小鼠异位气管移植模型及人小气道上皮细胞的RNA测序表达谱数据
![GSE349082: SGK1 Mediates TGF-β1-Induced Epithelial-Mesenchymal Transition and Fibrosis in Experimental Bronchiolitis Obliterans [SGK]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/145060.jpg)
基本信息
资源简介
SGK1介导TGF-β1诱导的实验性闭塞性细支气管炎上皮-间质转化与纤维化[SGK]
SGK1 Mediates TGF-β1-Induced Epithelial-Mesenchymal Transition and Fibrosis in Experimental Bronchiolitis Obliterans [SGK]
该数据集来自NCBI GEO,围绕SGK1在肺移植后闭塞性细支气管炎(BO)纤维化中的作用,包含小鼠异位气管移植模型及人小气道上皮细胞的RNA测序表达谱数据。源站描述显示,BO病变第28天SGK1显著上调,药物抑制(EMD638683)或siRNA敲低SGK1可减弱TGF-β1诱导的上皮-间质转化。数据可用于研究SGK1与TGF-β1通路在BO纤维化中的交互机制及表达变化分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):闭塞性细支气管炎(BO)是限制肺移植后长期生存的主要并发症,上皮-间质转化(EMT)是其核心致病机制。TGF-β1信号通路在EMT诱导中起关键作用,并可激活血清/糖皮质激素调节激酶1(SGK1)表达。尽管SGK1在多种纤维化疾病中上调,其在BO中的功能意义尚不明确。为阐明SGK1在移植后BO纤维化中的作用及其与TGF-β1通路的交互,我们建立了小鼠异位气管移植模型。组织病理学评估和RNA测序显示,至第28天BO病变中SGK1显著上调。体外实验中,药物抑制(EMD638683)和基因敲低SGK1(siRNA)均减弱了TGF-β1诱导的人小气道上皮细胞EMT。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349082
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 30 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
闭塞性细支气管炎(BO)是限制肺移植术后长期生存的主要并发症,上皮-间质转化(EMT)是其核心致病机制。TGF-β1信号通路在EMT诱导中发挥关键作用,并可激活血清/糖皮质激素调节激酶1(SGK1)的表达。尽管SGK1在多种纤维化疾病中表达上调,但其在BO中的功能意义尚不明确。为阐明SGK1在移植后BO纤维化中的作用及其与TGF-β1通路的相互作用,我们建立了小鼠异位气管移植模型。组织病理学评估和RNA测序显示,至第28天时BO病变中SGK1显著上调。体外实验中,药物抑制(EMD638683)和基因敲低SGK1(siRNA)均可减弱TGF-β1诱导的人小气道上皮细胞系(HSAECs)EMT,同时抑制细胞外基质基因(COL1和FN1)的表达。此外,抑制SGK1可减少TGF-β1诱导的SMAD2/3磷酸化。
在疾病确立后开始给予EMD638683治疗,可显著改善BO病理。这些发现表明,SGK1通过TGF-β1介导的EMT和ECM沉积促进BO相关纤维化,从而确定SGK1是移植后BO干预的潜在治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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