肺泡2型细胞中VAPA依赖的脂质转运促进肺表面活性物质形成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348519

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数据说明

VAP蛋白通过与含FFAT的蛋白质相互作用，在内质网（ER）与其他细胞器之间形成膜接触位点（MCS），从而协调脂质的合成、转移和代谢。然而，其组织特异性功能在很大程度上仍未被探索。在此，我们报告了首例携带VAPA纯合无义变异（p.(Glu12*)）的患者，表现为严重的全面发育迟缓以及进行性表面活性物质功能障碍，导致胆固醇性肺炎和肺纤维化。替代翻译起始部分绕过了提前终止密码子，产生了一种N端截短的VAPA蛋白，其FFAT结合能力受损。在肺泡2型细胞中，VAPA缺陷会损害板层体（LB）的形成。我们鉴定出与肺部疾病相关的ATP结合盒转运蛋白A3（ABCA3）——LB中表面活性物质脂质积累的关键调节因子——是VAPA的新型相互作用蛋白。VAPA–ABCA3相互作用促进了先前未被表征的ER–LB MCS处的脂质交换，而这一功能在VAPA的N端截短后丧失。

总之，我们的研究结果确定了VAPA依赖性MCS功能受损是综合征性肺病的一种机制，并揭示了一条此前未被认识的表面活性物质脂质运输途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。