GSE34789：受牵张与未受牵张的Calu-3肺上皮细胞表达水平
该数据集来自NCBI GEO，比较受牵张与未受牵张的Calu-3人肺上皮细胞在基因表达水平上的差异，使用人全基因组U133 Plus 2.0芯片进行表达谱检测，共1个文件（GSE34789_series_matrix.txt.gz）
基本信息
资源简介
GSE34789：受牵张与未受牵张的Calu-3肺上皮细胞表达水平
Expression levels in strained vs. non-strained Calu-3 lung epithelial cells
该数据集来自NCBI GEO，比较受牵张与未受牵张的Calu-3人肺上皮细胞在基因表达水平上的差异，使用人全基因组U133 Plus 2.0芯片进行表达谱检测，共1个文件（GSE34789_series_matrix.txt.gz）。研究背景为呼吸机诱导肺损伤可导致ARDS等高死亡率疾病，作者假设表达水平变化有助于识别影响炎症与结局的关键靶基因，并据此鉴定出上调基因类别。数据可用于差异表达分析、牵张相关炎症机制探索及候选靶基因筛选（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 30 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：呼吸机诱导肺损伤可导致ARDS等严重疾病，其死亡率较高（约30%，Stapleton等，Chest，2005）。我们假设不同基因表达水平的变化将有助于识别关键靶基因，这些基因可能影响与该疾病相关的炎症和结局。我们使用人全基因组U133 Plus 2.0微阵列来详细描述基因表达的变化，并在此过程中鉴定出不同类别的上调基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE34789
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE34789
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
呼吸机相关性肺损伤可导致如ARDS等严重病症，其死亡率较高（约30%，Stapleton等，《Chest》，2005年）。我们假设不同基因表达水平的变化能引导我们发现关键靶基因，这些基因可能影响与该病症相关的炎症及预后。我们采用人类全基因组U133 Plus 2.0微阵列来详细分析基因表达的变化，并在此过程中识别出不同类别的上调基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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