同源与异源mRNA及MVA疫苗接种后对SARS-CoV-2 XBB.1.5的长期免疫与保护

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344507

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数据说明

尽管基于mRNA的COVID-19疫苗已显示出高效力，但其全球广泛使用仍受限于高生产成本和冷链要求。改良安卡拉痘苗病毒（MVA）是一种高度减毒且热稳定的病毒载体，具有生产成本低、免疫原性强以及全球分发潜力大的优势。在此，我们在K18-hACE2小鼠中头对头比较了一种基于MVA的候选疫苗与一种已获批mRNA疫苗的长期免疫原性和保护效力，两者均表达SARS-CoV-2奥密克戎XBB.1.5刺突（S）蛋白。小鼠通过肌内途径接受同源（mRNA/mRNA和MVA/MVA）、异源（mRNA/MVA）或单剂MVA免疫方案。在加强免疫后10天和9个月评估了SARS-CoV-2特异性体液和细胞免疫应答，以及中间时间点的抗体水平，并在疫苗接种后9个月经鼻内SARS-CoV-2 XBB.1.5攻击后评估了保护作用。

针对XBB.1.5刺突蛋白的结合IgG抗体在所有疫苗接种组中于整个9个月期间均保持高水平，而中和抗体滴度在加强免疫后早期达到峰值并逐渐下降，随时间推移各免疫方案间趋于一致。S特异性CD8⁺ T细胞应答在含mRNA的免疫方案中于加强免疫后第10天最强，尽管随时间推移有所收缩，但在所有两剂组中于加强免疫后9个月仍可检测到，且异源mRNA/MVA方案中呈现持久性增强的趋势。相比之下，S特异性CD4⁺ T细胞应答在所有组中均保持较低水平。所有两剂免疫方案均对SARS-CoV-2 XBB.1.5攻击提供强有力保护，显著降低上呼吸道和下呼吸道中的病毒RNA水平和感染性滴度。病毒攻击后肺组织的转录组分析显示，接种疫苗的动物中与炎症性髓系应答、干扰素信号传导及ce相关的基因表达降低

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。