羟丁酸钠重塑肠道菌群并缓解发育期与已建立肥胖的代谢功能障碍

研究使用饮食诱导的预肥胖和肥胖小鼠模型,观察羟丁酸钠(SXB)对肝脏脂肪变性、炎症、胰岛素抵抗、体重及脂肪组织功能的影响,并涉及肠道菌群重塑和粪菌移植实验

geo
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基因组分类GPL1702110090
GSE342666: Sodium oxybate, a narcolepsy therapeutic, remodels the gut microbiota and alleviates metabolic dysfunction in developing and established obesity

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

羟丁酸钠重塑肠道菌群并缓解发育期与已建立肥胖的代谢功能障碍

Sodium oxybate, a narcolepsy therapeutic, remodels the gut microbiota and alleviates metabolic dysfunction in developing and established obesity

该数据集来自 NCBI GEO(GSE342666),包含 1 个文件(GSE342666_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为 GPL17021。研究使用饮食诱导的预肥胖和肥胖小鼠模型,观察羟丁酸钠(SXB)对肝脏脂肪变性、炎症、胰岛素抵抗、体重及脂肪组织功能的影响,并涉及肠道菌群重塑和粪菌移植实验。数据可用于探索 SXB 改善肥胖相关代谢功能障碍的转录组变化及菌群相关机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们使用饮食诱导的预肥胖和肥胖小鼠模型,发现 SXB 在两种情况下均减轻了肝脏脂肪变性和炎症,同时增加了与线粒体呼吸功能相关的基因表达。在肥胖小鼠中,SXB 通过限制脂肪量扩张进一步改善了胰岛素抵抗并减轻了体重增加。这些代谢改善伴随着脂肪组织功能的增强,表现为白色脂肪组织中脂肪细胞肥大和炎症减少,以及棕色脂肪组织中脂质含量降低和解偶联蛋白 1(UCP-1)丰度增加。在机制上,SXB 重塑了肠道菌群,其方式有助于与改善的肝脏代谢功能相关联。与微生物群的因果作用一致,来自 SXB 处理的肥胖供体的粪菌移植(FMT)在未处理

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL17021、10090。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342666

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们利用饮食诱导的肥胖前期和肥胖小鼠模型发现,SXB在两种状态下均能减轻肝脏脂肪变性和炎症,并伴随与线粒体呼吸功能相关基因表达的升高。在肥胖小鼠中,SXB进一步改善了胰岛素抵抗,并通过限制脂肪量扩张来减缓体重增加。这些代谢改善伴随着脂肪组织功能的增强,表现为白色脂肪组织中脂肪细胞肥大和炎症的减少,以及棕色脂肪组织中脂质含量的降低和解偶联蛋白1(UCP-1)丰度的增加。在机制上,SXB重塑了肠道菌群,其方式有助于改善肝脏代谢功能。与菌群的因果作用相一致,来自SXB治疗的肥胖供体的粪菌移植(FMT)在未治疗的肥胖受试者中重现了这些益处,挽救了饮食诱导的体重增加、高血糖和肝脏脂肪变性。

这些发现表明,肠道微生物群可能是SXB代谢效应的关键潜在介导因素,支持对发作性睡病中肠道微生物群改变的进一步研究,并强调了药物-微生物群相互作用在代谢功能障碍中的广泛转化相关性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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