GSE331101:Podnl1 作为 HIV 相关肺血管疾病的新贡献因子
研究利用三种 HIV 小鼠模型及体外细胞实验,检验 HIV 相关蛋白通过 Podnl1 依赖机制诱导 PVD 的假设,发现 Tg26 小鼠及 Tg26 骨髓移植小鼠中 HIV 蛋白表达促进 PVD 且无性别差异,RNAseq 与 qPCR 首次揭示 HIV 模型肺内 Podnl1 高表达

基本信息
资源简介
GSE331101:Podnl1 作为 HIV 相关肺血管疾病的新贡献因子
Podnl1 as a novel contributor to HIV-associated pulmonary vascular disease
该数据集来自 NCBI GEO(GSE331101),围绕 Podnl1 在 HIV 相关肺血管疾病(PVD)中的作用展开,包含 1 个文件(GSE331101_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(GPL24247,10090)。研究利用三种 HIV 小鼠模型及体外细胞实验,检验 HIV 相关蛋白通过 Podnl1 依赖机制诱导 PVD 的假设,发现 Tg26 小鼠及 Tg26 骨髓移植小鼠中 HIV 蛋白表达促进 PVD 且无性别差异,RNAseq 与 qPCR 首次揭示 HIV 模型肺内 Podnl1 高表达。数据可用于探索 HIV 相关肺血管疾病的分子机制与 Podnl1 相关预测。
【数据集背景】
源站首次发布:May 15 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):得益于联合抗逆转录病毒治疗(cART)的出现,HIV 感染者(PWH)的预期寿命显著增加;然而,他们也表现出对发生严重肺血管疾病(PVD)的易感性升高。尽管已努力了解 HIV 编码蛋白在该疾病发病机制中的作用,其潜在机制仍有待阐明。我们使用三种 HIV 小鼠模型和体外细胞研究,检验了 HIV 相关蛋白通过 Podnl1 依赖机制诱导 PVD 的假设。我们报道,Tg26 小鼠中 HIV 蛋白的表达以及从 Tg26 到野生型小鼠的骨髓移植促进了 PVD 的发展,且无性别差异。RNAseq 和 qPCR 分析首次揭示,在我们的 HIV 模型肺中 Podnl1 高表达。引人注目的是,接受 cART 的 PWH 的肺标本表现出更高的 Podnl1 l
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331101
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 18 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331101
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
得益于联合抗逆转录病毒治疗(cART)的出现,HIV感染者(PWH)的预期寿命显著增加;然而,他们也表现出对发生严重肺血管疾病(PVD)的易感性升高。尽管已努力了解HIV编码蛋白在该疾病发病机制中的作用,但其潜在机制仍有待阐明。我们使用三种HIV小鼠模型和体外细胞研究,检验了HIV相关蛋白通过Podnl1依赖机制诱导PVD的假说。我们报道,Tg26小鼠中HIV蛋白的表达以及从Tg26小鼠到野生型小鼠的骨髓移植促进了PVD的发生,且无性别差异。RNAseq和qPCR分析首次揭示,在我们的HIV模型肺部中Podnl1高表达。引人注目的是,接受cART治疗的PWH的肺标本与HIV阴性个体相比表现出更高的Podnl1水平。我们还揭示,所观察到的心肺改变和Podnl1表达水平在老年完整Tg26小鼠中更为明显。此外,Podnl1过表达导致胶原-I产生增加和PASMCs增殖。
值得注意的是,我们发现HIV-Tat是唯一在接受cART治疗的PWH外周血单核细胞中可检测到的病毒蛋白,并且小鼠长期暴露于HIV-Tat可重现完整及BMT Tg26小鼠的心肺并发症。我们首次提供证据表明,HIV-Tat和Podnl1是HIV感染相关PVD的重要促进因素,这为预防HIV相关心肺并发症提供了潜在的新治疗途径。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




