上呼吸道效应与驻留记忆前体T细胞感染早期转录谱

该数据集来自 NCBI GEO,包含野生型小鼠腹腔感染 A/HKx31 流感病毒后第 12 天鼻腔组织的流感特异性记忆前体 TRM 与 TEM 细胞,经活体标记和表面标志物(CD127、KLRG1、CD69、CD103)分选后进行 bulk RNA 测序

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时间序列分类GPL2424710090
GSE327966: Upper respiratory tract effector and resident memory precursor T cells have distinct transcriptional profiles early after infection in the absence of local antigen

基本信息

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时间序列
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分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

上呼吸道效应与驻留记忆前体T细胞感染早期转录谱

Upper respiratory tract effector and resident memory precursor T cells have distinct transcriptional profiles early after infection in the absence of local antigen

该数据集来自 NCBI GEO,包含野生型小鼠腹腔感染 A/HKx31 流感病毒后第 12 天鼻腔组织的流感特异性记忆前体 TRM 与 TEM 细胞,经活体标记和表面标志物(CD127、KLRG1、CD69、CD103)分选后进行 bulk RNA 测序。数据用于比较上呼吸道两类记忆前体 T 细胞的差异表达基因和靶向基因集富集,揭示在缺乏局部抗原时二者仍具有转录上不同的发育程序,可供呼吸系统抗病毒免疫与组织驻留记忆 T 细胞研究使用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 14 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为研究发育中的上呼吸道(URT)效应记忆(TEM)和驻留记忆(TRM)T 细胞的转录程序,我们用 A/HKx31 流感病毒对野生型小鼠进行腹腔感染,并在感染后第 12 天处理鼻腔组织。通过活体标记和表面标志物(CD127、KLRG1、CD69、CD103)鉴定流感特异性记忆前体 TRM 和 TEM,并分选进行 bulk RNA 测序。差异表达基因分析及使用公开数据集的靶向基因集富集分析显示,两个亚群均上调与真正的组织驻留记忆或效应记忆特征相关的基因,表明在缺乏局部抗原的情况下,其他环境信号线索可能协调这些转录上不同的 URT 亚群的发育。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327966

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 09 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为研究发育中上呼吸道(URT)效应记忆(TEM)和组织驻留记忆(TRM)T细胞的转录程序,我们用A/HKx31流感病毒腹腔感染野生型小鼠,并在感染后12天处理鼻腔组织。通过活体标记和表面标志物(CD127、KLRG1、CD69、CD103)鉴定出流感特异性记忆前体TRM和TEM,并分选进行批量RNA测序。对差异表达基因的分析以及利用公开数据集进行的靶向基因集富集分析显示,这两个亚群均上调了与真正的组织驻留记忆或效应记忆特征相关的基因,表明在缺乏局部抗原的情况下,其他环境信号线索可能协调了这些转录上截然不同的URT亚群的发育。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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