CD69调控表观遗传印记记忆CD4+ T细胞组织动态的RNA-seq与ATAC-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325227

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

组织驻留记忆T（TRM）细胞存在于非淋巴组织中，构成抵御病原体的第一道防线。一部分TRM细胞可从非淋巴组织进入循环。然而，再循环TRM细胞的功能后果及表观遗传印记的程度仍不清楚。我们在此证明，在CD4+ TRM细胞中，CD69-S1PR1轴控制组织驻留，阻断该轴可导致肺CD4+ TRM细胞被清除。CD69+CD4+ TRM细胞的一个亚群经淋巴管重新进入循环，并在小鼠和人类中均表观遗传地维持了TRM细胞的特征。与循环记忆细胞相比，小鼠循环中的Ex-lung-TRM细胞引起了更强的皮肤炎症。此外，我们将GPR183和CD161鉴定为人类PBMC中Ex-TRM的潜在标志物。因此，在慢性炎症性疾病中，过敏性炎症向多个组织的转移可能通过组织印记记忆CD4+ T细胞的再循环而发生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。