GSE32245：Fiorentino 2006-7 皮肌炎、狼疮与对照皮肤

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE32245

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：皮肌炎（DM）是一种主要累及皮肤、肌肉和肺的自身免疫性疾病。DM皮肤炎症的发病机制尚不清楚。方法与发现：我们分析了DM皮肤的全基因组表达数据，并将其与健康对照的数据进行比较。我们观察到DM皮肤中干扰素（IFN）诱导基因显著上调，以及其他几个与炎症、补体激活以及表皮活化和分化相关的基因模块。DM特征中的干扰素（IFN）诱导基因不仅存在于DM和狼疮中，也存在于皮肤单纯疱疹-2感染中，并在较小程度上存在于银屑病中。该IFN特征在特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、寻常痤疮、系统性硬化症和局限性硬皮病/莫菲亚中缺失或微弱存在。基于体外IFN刺激表达特征，我们观察到DM皮肤中的IFN特征似乎与I型IFN的关系比II型IFN更密切。然而，DM皮肤中IFN mRNA的定量显示，大多数已知的I型IFN以及IFNγ在DM皮肤中过表达。

此外，IFN-beta和IFN-gamma（而非其他I型IFN）的转录水平与DM皮肤中体内IFN转录反应的程度高度相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。