Tabamide A衍生物TA25抗人鼻病毒及多种人畜共患病毒的体外与计算机模拟抗病毒和抗炎效应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319110

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人鼻病毒（HRV）于1956年首次分离，属于小RNA病毒科。HRV可引起轻度感冒和严重呼吸道疾病。迄今为止，尚无FDA批准的抗病毒或抗炎药物可用。TA25是一种从烟草（Nicotiana tabacum）中提取的酚酰胺衍生物。为探究其作为抗病毒治疗候选药物的潜力，我们评估了TA25对HRV及多种人畜共患病毒的抗病毒效力。采用RT-qPCR和RNA-seq评估抗病毒和抗炎效果。进行链特异性RT-qPCR以检测TA25处理后基因组RNA和反基因组RNA的表达。此外，开展基于人工智能的对接试验以研究TA25与病毒蛋白的结合亲和力。TA25显著降低病毒复制并抑制促炎基因的表达。链特异性RT-qPCR证实了TA25处理对病毒复制的抑制作用。TA25对多种病毒表现出广谱抗病毒活性，包括HRV-1A、ZIKV、DENV、VACV和IBV。通过AI驱动的基于结构的对接分析，TA25与HRV 2B蛋白显示出最强的结合亲和力。

本研究表明，TA25对HRV及多种人畜共患病毒具有广谱抗病毒和抗炎活性。这些发现为TA25作为应对新发RNA和DNA病毒的有前景的治疗候选药物的抗病毒策略提供了有价值的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。