纤维化过敏性肺炎血液分子内分型数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318816

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

纤维化性过敏性肺炎（fHP）是一种由抗原驱动的致命性间质性肺病，治疗选择有限。我们运用多种分析算法，在fHP队列全血转录组中识别出两种具有不同免疫特征的分子内型，并在全血、外周血单个核细胞、支气管肺泡灌洗液、外科肺活检组织转录组以及血浆蛋白质组中进行了验证。淋巴细胞型内型（L-fHP）占fHP病例的三分之二，显示适应性免疫通路富集和淋巴细胞优势；而非淋巴细胞型内型（N-fHP）则表现为固有免疫通路富集，以中性粒细胞和巨噬细胞为主。与L-fHP病例相比，N-fHP病例基线肺功能较低，无移植生存期缩短，然而皮质类固醇治疗与L-fHP较差的無移植生存期相关，对N-fHP则无影响。这些结果表明，基于血液的分子内型分析能够揭示预后和治疗方面的洞见，并推动传统临床表型分析无法实现的精准医学。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。