发展为BPD的婴儿具有由vimentin表达和纤毛缺失定义的气道内型 [RNA-Seq P199-9Data]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318544

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

理由：支气管肺发育不良（BPD）源于早产后肺发育受阻，并在呼吸树的各个层面造成结构缺陷。下气道疾病正逐渐被视为一种具有临床意义的BPD表型，其死亡率增加，然而早产破坏气道发育的分子机制仍不明确。目的：建立早产后下气道疾病的人体模型，并界定 evolving BPD（eBPD）在基线和损伤反应中的分子内型。方法：将离体器官型气道上皮细胞（AEC）模型与特征明确的病理学和转录组学患者样本相结合，用于定量免疫组化和RNA测序分析。测量与主要结果：与健康对照的AEC相比，eBPD来源的AEC表现出增殖减少、向纤毛上皮分化受损，以及波形蛋白阳性细胞群的扩增，其转录谱与AEC分化受损相关。

在高氧暴露后，来源于eBPD的气道上皮细胞（AECs）在离体条件下表现出强烈的波形蛋白反应，这与在患有BPD的人类婴儿肺组织气道细胞中观察到的波形蛋白表达增加相平行。结论：利用新生儿气道分化的器官型模型，我们证明eBPD与AEC分化受损、波形蛋白表达增加及纤毛细胞 concomitant 丢失相关，并且对高氧损伤表现出过度的波形蛋白反应。这些发现模拟了人类患者气道上皮细胞中早产的影响。这些数据支持一种机制，即高氧导致BPD中上皮分化受损及相关下气道功能障碍，并为未来探究中间丝在BPD演变中作用的机制研究提供了依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。