桔梗皂苷D改善特发性肺纤维化小鼠的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317792

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究聚焦于PD——一种源自中药的天然化合物——在IPF防治中的作用，而肺成纤维细胞向肌成纤维细胞转分化是IPF的关键致病驱动因素。通过采用体内和体外IPF模型，并结合转录组分析、Lip-SMap、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析（CETSA）和表面等离子体共振（SPR）等技术，研究表明PD在IPF模型中可减轻肺损伤、缓解全身及肺部炎症、降低氧化应激，并显著抑制肌成纤维细胞转分化。进一步的机制研究确定PPP2R1A为PD的直接靶点；PD通过与PPP2R1A结合，稳定并激活蛋白磷酸酶2A（PP2A），从而抑制PI3K/Akt信号通路。总体而言，这些发现表明PD至少部分通过PPP2R1A/PP2A/PI3K/Akt轴发挥抗IPF作用，凸显了其作为靶向肌成纤维细胞转分化的IPF治疗药物的潜在价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。