NOD/ShiLtJ 干燥综合征小鼠模型纤维化重塑的单细胞转录组与 AI 定量研究

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE314772

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数据说明

干燥综合征（Sjögren’s Disease, SjD）是一种以唾液腺功能减退和淋巴细胞浸润为特征的系统性自身免疫性疾病，然而纤维化对腺体功能障碍的作用仍不明确。NOD/ShiltJ小鼠是SjD公认的成熟模型。本研究评估了NOD/ShiLtJ小鼠唾液腺中纤维化的存在及其影响。我们采用scRNASeq技术研究了NOD小鼠与对照小鼠成纤维细胞的差异基因表达。与对照品系相比，NOD小鼠唾液腺中的成纤维细胞群体表现出细胞外基质mRNA水平升高，包括Col1a1、Col1a2和Col3a1。通过天狼星红组织学染色和AI驱动的纤维化定量分析，我们发现非肥胖糖尿病NOD/ShiLtJ小鼠的颌下腺相对于对照组存在显著的纤维化重塑，且与该小鼠品系的糖尿病表型相关。我们评估了尼达尼布（Nintedanib）缓解该纤维化表型的治疗潜力。尼达尼布是FDA批准用于慢性纤维化间质性肺病的抗纤维化药物。

虽然尼达尼布未能显著减少免疫浸润或恢复唾液腺功能，但在长期治疗队列中，它适度降低了多项纤维化评分。这些发现表明，NOD/ShiLtJ品系能够模拟SjD患者中发生的纤维化反应，并支持对唾液腺功能障碍的抗纤维化疗法进行进一步研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。