衰老相关肠道菌群失调削弱肠-肺轴抗流感病毒防御

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313182

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数据说明

衰老伴随着肠道微生物群的深刻变化，包括微生物多样性降低、代谢能力改变以及全身性低度炎症，从而增加对甲型流感病毒（IAV）等呼吸道病毒感染的易感性。越来越多的证据表明，微生物代谢产物，尤其是短链脂肪酸（SCFAs），通过调节肠-肺轴内的炎症反应和抗病毒防御，有助于增强宿主的抵抗力。在此，我们研究了衰老、微生物失调与IAV感染之间的相互作用。在小鼠模型中，衰老与微生物群组成和代谢的显著变化相关，其中嗜黏蛋白阿克曼菌（Akkermansia muciniphila）和啮齿粪杆菌（Faecalibaculum rodentium）等共生菌减少。同时，参与碳水化合物发酵的酶表达降低，提示SCFA产生受损。IAV感染进一步加剧了老年小鼠中的这些改变。此外，我们还进行了衰老的人原代肺成纤维细胞的体外补充实验，以进一步分析感染期间SCFA与年龄相关的作用。

衰老细胞对IAV感染更为易感，但补充短链脂肪酸乙酸盐可显著降低病毒复制和炎症反应。机制上，这些保护作用由短链脂肪酸受体GPR41和GPR43的激活以及通过组蛋白乙酰化增强的基因表达所介导。总之，我们的研究结果揭示，衰老相关的微生物失调导致短链脂肪酸产生减少，从而削弱抗病毒防御机制。重要的是，我们证明补充乙酸盐可特异性恢复衰老细胞中的抗病毒反应，突显了微生物组对健康衰老的相关性，并将肠-肺轴确定为治疗干预的有前景靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。