GSE309972：表达Stc1的肌成纤维细胞是发育上独特的谱系，在新生肺中通过凋亡被清除
该数据集来自NCBI GEO，包含一个系列矩阵文件，主题为表达谱分析（高通量测序），物种为小鼠（10090），平台为GPL34328
基本信息
资源简介
GSE309972：表达Stc1的肌成纤维细胞是发育上独特的谱系，在新生肺中通过凋亡被清除
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through apoptosis in the neonatal lung
该数据集来自NCBI GEO，包含一个系列矩阵文件，主题为表达谱分析（高通量测序），物种为小鼠（10090），平台为GPL34328。研究利用Stc1CreERT2小鼠品系标记发育 transient 的次级嵴肌成纤维细胞（SCMF），通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示SCMF经克隆增殖扩增、经凋亡清除，且删除Bax和Bak1可阻止其清除。数据可用于研究肺泡发育中肌成纤维细胞谱系的转录特征与凋亡机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 14 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：肺肌成纤维细胞是出生后早期肺泡生长所必需的。现有遗传工具尚无法解析单个肌成纤维细胞谱系对肺泡发育的独特贡献。我们构建了Stc1CreERT2小鼠品系，标记发育 transient 的次级嵴肌成纤维细胞（SCMF），将其与肺泡管肌成纤维细胞（DMF）和平滑肌区分开。SCMF通过表达Stc1的祖细胞的克隆增殖而扩增，并通过凋亡被清除。在Stc1谱系中删除凋亡效应因子Bax和Bak1可阻止肺泡生成过程中SCMF的清除。单细胞RNA测序显示，存活的Stc1谱系细胞失去肌成纤维细胞身份，同时共表达SCMF和DMF标志物。胚胎谱系追踪鉴定了SCMF和DMF的独特祖细胞，而Hedgehog（Hh）或Wnt信号通路的遗传激活未能
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL34328、10090。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309972
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 19 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
肺肌成纤维细胞是出生后早期肺泡生长所必需的。现有遗传学工具尚无法解析各个肌成纤维细胞谱系对肺泡发育的独特贡献。我们构建了Stc1CreERT2小鼠品系，该品系可标记发育过程中短暂存在的次级嵴肌成纤维细胞（SCMFs），从而将其与肺泡管肌成纤维细胞（DMF）及平滑肌区分开来。SCMFs通过表达Stc1的祖细胞的克隆性增殖而扩增，并通过凋亡被清除。在Stc1谱系中敲除凋亡效应分子Bax和Bak1可阻止肺泡化过程中SCMF的清除。单细胞RNA测序显示，存活的Stc1谱系细胞失去了肌成纤维细胞身份，同时共表达SCMF和DMF标志物。胚胎期谱系追踪鉴定出SCMFs和DMFs具有不同的祖细胞，且遗传学激活Hedgehog（Hh）或Wnt信号通路未能使这些谱系相互转化。这些发现确立了Stc1谱系SCMFs为一个独立的、发育上趋异的细胞群体，并界定了其独立于其他肌成纤维细胞谱系的生命周期。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
