博来霉素诱导与多西环素诱导TGF-β转基因小鼠肺纤维化模型肺细胞单细胞RNA测序
该数据集为博来霉素诱导及多西环素诱导TGF-β转基因小鼠肺纤维化模型的肺细胞单细胞RNA测序数据,包含1个文件(GSE309471_series_matrix.txt.gz),来源于NCBI GEO

基本信息
资源简介
博来霉素诱导与多西环素诱导TGF-β转基因小鼠肺纤维化模型肺细胞单细胞RNA测序
Single-cell RNA sequencing of lung cells from bleomycin-induced and doxycycline-inducible TGF-β transgenic mouse models of pulmonary fibrosis
该数据集为博来霉素诱导及多西环素诱导TGF-β转基因小鼠肺纤维化模型的肺细胞单细胞RNA测序数据,包含1个文件(GSE309471_series_matrix.txt.gz),来源于NCBI GEO。研究对野生型对照及Mif-2 KO、SPC-Cul3 KO、SPC-Mif KO、CX3CR1-Cd74 KO、PF4-Cd74 KO和TGF-β转基因小鼠的肺细胞进行单细胞转录组分析,旨在阐明上皮-巨噬细胞相互作用在肺纤维化中的作用。数据可用于肺纤维化相关细胞类型识别、差异表达分析及上皮-巨噬细胞互作研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在阐明上皮-巨噬细胞相互作用如何促进肺纤维化。我们使用博来霉素诱导和遗传小鼠模型(Mif-2 KO、SPC-Cul3 KO、SPC-Mif KO、CX3CR1-Cd74 KO、PF4-Cd74 KO和TGF-β转基因小鼠),对肺细胞进行单细胞转录组分析,并与野生型对照进行比较。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309471
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 02 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309471
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在阐明上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用如何促进肺纤维化。我们采用博来霉素诱导的和遗传性小鼠模型(Mif-2基因敲除、SPC-Cul3基因敲除、SPC-Mif基因敲除、CX3CR1-Cd74基因敲除、PF4-Cd74基因敲除及TGF-β转基因小鼠),对肺细胞进行了单细胞转录组分析,并与野生型对照进行比较。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




