BET抑制靶向致病性间质巨噬细胞限制闭塞性细支气管炎慢性GVHD中抗体介导的纤维化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307707

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数据说明

慢性移植物抗宿主病（cGVHD）是异基因造血干细胞移植后晚期死亡的主要原因，其中闭塞性细支气管炎综合征（BOS）是最致命的治疗抵抗性并发症之一。尽管已有4种二线疗法获批，但中度和重度BOS患者的临床缓解率仍然不佳。含溴结构域和超末端结构域（BET）蛋白是表观遗传阅读器，在多种细胞类型中驱动致癌和炎症性转录程序。我们假设，通过抑制BET来限制直接的炎症性T细胞以及已知的巨噬细胞向促纤维化表型极化，将是一种可行的治疗选择。我们使用了一个已建立的BOS cGVHD模型，在该模型中以可转化的BET抑制剂OPN-51107（BETi）治疗cGVHD小鼠。我们发现，在BETi作用下，T细胞和B细胞的生发中心（GC）迁移能力降低，GC活化减少，导致IgG1+类别转换B细胞减少。cGVHD小鼠循环中及沉积于肺组织上的致病性IgM和IgG1均升高，而在BET抑制下这些指标得以减弱。此外，cGVHD中产生的抗体既具有同种异体反应性，也具有自身反应性。

单细胞RNA测序分析揭示了BOS肺组织中的22种不同细胞类型。在cGVHD小鼠中，GSEA分析显示肺泡巨噬细胞（AM）和间质巨噬细胞（IM）中抗炎性Arginase1和促纤维化Tgfb1表达上调，而BETi治疗小鼠中这些表达显著降低。光谱流式细胞术证实，BETi通过减少CD206+FcgR+ M2型IM和AM，靶向肺浸润性M2巨噬细胞。最终，BETi治疗小鼠的胶原沉积减少、肺功能改善。我们确定BET蛋白是BOS炎症的关键调控因子。BETi抑制Tfh和GC B细胞，从而减少抗体产生和沉积。在肺内，BETi选择性靶向M2型IM巨噬细胞，以减少FcgR和TGF-b表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。