SMRT-RID突变经TR抑制导致I型肺泡上皮细胞相关呼吸窘迫综合征
研究展示C57Bl6小鼠SMRT核辅阻遏物敲入突变(SMRTmRID)因I型肺泡上皮细胞早熟导致新型呼吸窘迫综合征,丙硫氧嘧啶(PTU)可完全逆转该表型,并揭示TR与SMRT通过Klf2调控I型肺泡上皮细胞分化

基本信息
资源简介
SMRT-RID突变经TR抑制导致I型肺泡上皮细胞相关呼吸窘迫综合征
SMRT-RID mutation linked to Type I Pneumocyte Associated Respiratory Distress Syndrome via TR repression
该数据集来自NCBI GEO,包含1个表达谱芯片文件(GSE30661_series_matrix.txt.gz),基于GPL6885平台对小鼠(10090)进行表达谱分析。研究展示C57Bl6小鼠SMRT核辅阻遏物敲入突变(SMRTmRID)因I型肺泡上皮细胞早熟导致新型呼吸窘迫综合征,丙硫氧嘧啶(PTU)可完全逆转该表型,并揭示TR与SMRT通过Klf2调控I型肺泡上皮细胞分化。数据可用于呼吸系统疾病相关基因表达模式分析与分类研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 14 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们展示,在C57Bl6小鼠中核辅阻遏物SMRT的敲入突变(SMRTmRID)因I型肺泡上皮细胞早熟而产生一种新型呼吸窘迫综合征(RDS)。用抗甲状腺激素药物丙硫氧嘧啶(PTU)治疗可完全挽救SMRT诱导的RDS,提示甲状腺激素受体(TR)在肺发育中具有未被认识且必不可少的作用。我们展示TR和SMRT通过Klf2控制I型肺泡上皮细胞分化,而Klf2似乎直接激活I型肺泡上皮细胞基因程序。相反,缺乏肺Klf2的小鼠缺乏成熟I型肺泡上皮细胞并在出生后不久死亡,密切再现SMRTmRID表型。这些结果确定了第二种核受体TR在I型肺泡上皮细胞分化中的作用,并提示一种治疗糖皮质激素无反应性RDS的新治疗选择。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6885、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30661
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 14 201,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们展示,在C57Bl6小鼠中,核共抑制因子SMRT的敲入突变(SMRTmRID)因I型肺泡上皮细胞成熟不足而引发一种新型呼吸窘迫综合征(RDS)。使用抗甲状腺激素药物丙硫氧嘧啶(PTU)治疗能完全逆转SMRT诱导的RDS,提示甲状腺激素受体(TR)在肺部发育中具有未被认识的重要作用。我们发现,TR和SMRT通过Klf2控制I型肺泡上皮细胞的分化,而Klf2似乎直接激活I型肺泡上皮细胞的基因程序。相反,缺乏肺Klf2的小鼠缺少成熟的I型肺泡上皮细胞,出生后不久即死亡, closely recapitulating the SMRTmRID phenotype。这些结果确定了第二种核受体——TR在I型肺泡上皮细胞分化中的作用,并提示了一种治疗糖皮质激素无反应性RDS的新疗法类型。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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