急性肺损伤中PARK7整合多不饱和脂肪酸代谢与H3K14乳酸化减轻内皮铁死亡及功能障碍
该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-Seq表达谱文件(GSE306296_series_matrix.txt.gz),主题为急性肺损伤中内皮细胞代谢变化与损伤的关系
![GSE306296: Metabolic Interplay in Acute Lung Injury: PARK7 Integrates PUFA Metabolism and H3K14 Lactylation to Attenuate Endothelial Ferroptosis and Dysfunction [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/142721.jpg)
基本信息
资源简介
急性肺损伤中PARK7整合多不饱和脂肪酸代谢与H3K14乳酸化减轻内皮铁死亡及功能障碍
Metabolic Interplay in Acute Lung Injury: PARK7 Integrates PUFA Metabolism and H3K14 Lactylation to Attenuate Endothelial Ferroptosis and Dysfunction [RNA-Seq]
该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-Seq表达谱文件(GSE306296_series_matrix.txt.gz),主题为急性肺损伤中内皮细胞代谢变化与损伤的关系。研究通过转录组与脂质组分析揭示LPS诱导ALI时肺内皮细胞PUFA合成通路下调,并涉及FADS1/2、omega-3脂肪酸、ALA补充及PARK7调控内皮铁死亡与屏障功能。数据可用于探索ALI/ARDS内皮代谢与铁死亡相关基因表达模式及候选调控因子(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 25 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):急性呼吸窘迫综合征(ARDS)是一种以肺部广泛炎症和液体积聚为特征的严重临床病症。急性肺损伤(ALI)中内皮细胞(EC)的代谢变化及其与损伤的关系尚不清楚。转录组和脂质组分析显示,在LPS诱导的ALI期间,肺内皮细胞中PUFA合成通路下调,尤其是omega-3 PUFAs。通过FADS1/2过表达或omega-3脂肪酸补充激活PUFA代谢通路,可保护内皮细胞免于铁死亡并恢复屏障功能。在ALI小鼠模型中过表达FADS1/2并结合α-亚麻酸(ALA)补充,可显著减轻肺损伤、减少炎症细胞因子并改善肺水肿和屏障完整性。PARK7被鉴定为FADS1/2的内源性调节因子,作用为th
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306296
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
急性呼吸窘迫综合征(ARDS)是一种严重的临床病症,以肺部广泛炎症和液体积聚为特征。急性肺损伤(ALI)中内皮细胞(EC)的代谢变化及其与损伤的关系尚不清楚。转录组学和脂质组学分析显示,在LPS诱导的ALI过程中,肺内皮细胞中PUFA合成通路下调,尤其是omega-3 PUFA。通过FADS1/2过表达或omega-3脂肪酸补充激活PUFA代谢通路,可保护内皮细胞免于铁死亡并恢复屏障功能。在ALI小鼠模型中过表达FADS1/2并结合α-亚麻酸(ALA)补充,可显著减轻肺损伤、减少炎性细胞因子并改善肺水肿和屏障完整性。PARK7被鉴定为FADS1/2的内源性调节因子,通过BMP-SMAD1/5/9信号通路发挥作用。在组蛋白H3K14乳酰化的驱动下(该过程也受FADS1/2下调的促进),PARK7上调恢复了FADS1/2表达并拮抗铁死亡,从而形成保护性反馈环路。
本研究阐明了一条新的调控轴,涉及ALI发病机制中的两大代谢变化——PUFA合成下调和组蛋白乳酸化上调,二者通过PARK7-BMP信号通路相互关联。靶向该调控轴为减轻ARDS/ALI中的内皮功能障碍和铁死亡提供了潜在的治疗策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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