急性LCMV（Armstrong）感染T细胞泛器官和时间进程分析（第60天）[I40]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301961

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究是immgenT开源项目的一部分，具体来自IGT40，该项目聚焦于急性LCMV（Armstrong株）感染后第60天T细胞的泛器官和时间进程分析。数据集包含从多个器官分离的T细胞：脾脏、前列腺、下颌下腺、骨髓、肠系膜淋巴结、小肠上皮、小肠固有层、肺和纵隔淋巴结。7周龄雄性C57BL/6J小鼠经腹腔注射2×10^5 PFU LCMV Armstrong株，并在感染后第60天（dpi）对T细胞进行分析。该研究包括内源性T细胞以及过继转移的P14和SMARTA TCR转基因T细胞。小鼠在感染前一天经静脉注射接受100,000个SMARTA（CD45.1.2）和50,000个P14（CD45.1）T细胞。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。