LncRNA RP11-284N8.3 调控脓毒症诱导急性肺损伤相关基因表达与可变剪接

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299503

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数据说明

脓毒症诱导的急性肺损伤(ALI)对人类健康构成重大威胁，亟需深入探究其潜在机制。长链非编码RNA(lncRNA)已成为包括脓毒症在内的多种疾病的关键调控因子。在我们前期研究中，我们观察到脓毒症患者血液样本中lncRNA RP11-284N8.3显著下调。在此，我们阐明了RP11-284N8.3在脂多糖(LPS)暴露的BEAS-2B细胞中的功能作用和调控分子靶点。最初，我们发现LPS处理显著抑制了RP11-284N8.3的表达。然而，RP11-284N8.3的过表达显著促进了细胞增殖，抑制了细胞凋亡，并减弱了LPS刺激下IL-1β的表达，表明其具有抗炎特性。进一步的RNA-seq分析显示，RP11-284N8.3可能促进了与炎症反应相关基因的显著下调，而与细胞周期/分裂和凋亡相关的基因则经历了可变剪接(AS)失调。

最后，采用RT-qPCR验证了受RP11-284N8.3调控的差异表达基因（DEGs）（ICAM5、GDF15、NECTIN4、SERPINB2）及AS基因（IL24、APEX1、PVT1、HNRNPUL1），结果与转录组变化一致。总之，RP11-284N8.3在LPS处理的BEAS-2B细胞中具有显著的全局调控作用，并可能对脓毒症诱导的ALI发挥保护作用。我们提出RP11-284N8.3及其下游靶点可作为未来脓毒症管理的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。