肺泡2型细胞LRP1对小鼠表面活性物质磷脂及肺功能的作用[人类]
研究围绕肺泡 2 型细胞中 LRP1 与表面活性物质磷脂代谢及肺功能的关系,涉及 LRP1 敲低的人肺泡 2 型细胞系与 T2C 特异性 LRP1 敲除小鼠模型
![GSE297307: Alveolar type 2 cell LRP1 is needed for surfactant phospholipids and pulmonary function in mice [human]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/168872.jpg)
基本信息
资源简介
肺泡2型细胞LRP1对小鼠表面活性物质磷脂及肺功能的作用[人类]
Alveolar type 2 cell LRP1 is needed for surfactant phospholipids and pulmonary function in mice [human]
该数据集来自 NCBI GEO(GSE297307),包含 1 个文件(GSE297307_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL15433。研究围绕肺泡 2 型细胞中 LRP1 与表面活性物质磷脂代谢及肺功能的关系,涉及 LRP1 敲低的人肺泡 2 型细胞系与 T2C 特异性 LRP1 敲除小鼠模型。数据可用于分析 LRP1 调控脂质代谢基因表达及表面活性物质磷脂分泌的相关转录组变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 15 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):低密度脂蛋白受体相关蛋白1(LRP1)具有多种功能并受细胞特异性调控。LRP1的遗传变异与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关,但其潜在机制尚不清楚。COPD会影响表面活性物质脂质代谢。为研究肺泡2型细胞(T2C)中的LRP1,我们用LRP1-shRNA(LRP1敲低,LRP1 KD)稳定转染了人T2C细胞系,并构建了T2C特异性LRP1敲除小鼠(SPC-LRP1-/-)。LRP1 KD细胞表现出表面活性物质磷脂分泌减少和中性脂质积累增加,尽管脂质代谢基因表达较低。从SPC-LRP1-/-小鼠分离的T2C和肺泡表面活性物质中,磷脂酰胆碱浓度低于Lrp1-floxed对照。在基线状态下,SPC-LRP1-/-降低了肺顺应性和用力肺活量。在smo
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL15433、9606。本站分类:呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297307
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 06 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
低密度脂蛋白受体相关蛋白1(LRP1)具有多种功能,并受细胞特异性调控。LRP1的遗传变异与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关,但其潜在机制尚不清楚。COPD会影响表面活性物质脂质代谢。为研究肺泡2型细胞(T2C)中的LRP1,我们用LRP1-shRNA稳定转染人T2C细胞系(LRP1敲低,LRP1 KD),并构建了T2C特异性LRP1敲除小鼠(SPC-LRP1-/-)。LRP1 KD细胞表现为表面活性物质磷脂分泌减少和中性脂质蓄积增加,尽管脂质代谢基因表达降低。从SPC-LRP1-/-小鼠分离的T2C和肺泡表面活性物质中,磷脂酰胆碱浓度低于Lrp1-floxed对照小鼠。在基线状态下,SPC-LRP1-/-小鼠肺顺应性和用力肺活量降低。烟雾暴露后,SPC-LRP1-/-小鼠的肺功能和肺气肿程度均较对照小鼠更差。RNA测序显示,T2C中LRP1缺失增加了与COPD相关的解毒和炎症通路的基因表达。
最后,公共人类数据查询显示,COPD患者的T2C中LRP1和脂质代谢基因的表达较低。本研究表明,T2C中的LRP1是表面活性物质脂质代谢和肺功能所必需的,并提示LRP1表达的降低促进COPD的发生。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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