人气道上皮转录路线图：HLF作为基底干细胞功能新型调控因子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295552

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

基底干细胞（BSCs）对于维持气道上皮至关重要，通过自我更新和分化驱动组织更新与修复。其功能受复杂的转录因子网络和信号通路调控。这些机制的失调会损害修复过程，并导致影响数百万患者的慢性肺部疾病。BSCs具有巨大的治疗潜力，尤其是作为先进治疗药品（ATMPs）的关注焦点。其促进组织再生与修复的能力为开发应对慢性呼吸系统疾病的创新策略提供了宝贵工具。为进一步发挥BSCs的作用，我们绘制了一份详细的转录因子图谱，涵盖健康人气道上皮在整个个体发育过程中的情况，揭示了所有细胞类型中的独特转录因子以及BSC功能的潜在调控因子。利用这一资源，我们在功能上鉴定出HLF是BSC功能的一种新型转录调控因子。我们的发现为利用BSC生物学改善COPD、IPF及其他慢性肺部疾病结局的靶向治疗策略提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。