PD-1high记忆表型CD4 T细胞经BATF/amphiregulin轴介导2型旁观者免疫并促进肺纤维化

研究通过FACS初步分离后,用IL-25和IL-33处理稳态CD4 T细胞,并进行单细胞RNA测序,以探究其分化过程。结果显示稳态PD-1high CD4 T细胞可分化为表达IL-13、IL-5和amphiregulin的致病性Th2细胞,提示其可能通过该分化过程参与肺纤维化

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE295241: PD-1high memory-phenotype CD4 T cells mediate type 2 bystander immunity and promote pulmonary fibrosis via BATF/amphiregulin axis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

PD-1high记忆表型CD4 T细胞经BATF/amphiregulin轴介导2型旁观者免疫并促进肺纤维化

PD-1high memory-phenotype CD4 T cells mediate type 2 bystander immunity and promote pulmonary fibrosis via BATF/amphiregulin axis

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE295241_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱技术,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。研究通过FACS初步分离后,用IL-25和IL-33处理稳态CD4 T细胞,并进行单细胞RNA测序,以探究其分化过程。结果显示稳态PD-1high CD4 T细胞可分化为表达IL-13、IL-5和amphiregulin的致病性Th2细胞,提示其可能通过该分化过程参与肺纤维化。数据可用于免疫细胞分化与肺纤维化机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)研究经FACS初步分离后,用IL-25和IL-33处理稳态CD4 T细胞的分化过程。该分析揭示稳态PD-1high CD4 T细胞分化为致病性Th2细胞,其特征为表达IL-13、IL-5和amphiregulin。这些发现提示稳态PD-1high CD4 T细胞可能通过分化为致病性Th2细胞而参与肺纤维化。该数据集包含来自[Min-Ji Cho et al., 2023]先前发表的scRNA-seq数据。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295241

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 19 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,探究了经FACS初步分离后,稳态CD4 T细胞在IL-25和IL-33处理下的分化过程。分析揭示,稳态PD-1高表达的CD4 T细胞可分化为致病性Th2细胞,其特征为表达IL-13、IL-5和双调蛋白。这些发现提示,稳态PD-1高表达的CD4 T细胞可能通过分化为致病性Th2细胞参与肺纤维化的进程。本数据集包含了先前由[Min-Ji Cho等人,2023年]发表的scRNA-seq数据。为了探究Pdcd1在CD4⁺ T细胞中的组织特异性作用,对从小鼠脾脏和肺部分离出的Pdcd1高表达和Pdcd1低表达CD4⁺ T细胞进行了批量RNA测序。差异基因表达分析显示,两种组织中的Pdcd1高表达CD4⁺ T细胞均富集了Th2和纤维化相关的基因特征。值得注意的是,脾脏与肺部的趋化因子受体表达谱存在差异,提示与Pdcd1表达相关的组织特异性转录程序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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