革兰阴性新生儿脓毒症中产白细胞介素-27细胞在肝脏呈现多样表型与功能
研究聚焦革兰阴性新生儿细菌性脓毒症中产 IL-27 细胞的表型与功能,利用 IL-27p28eGFP 报告小鼠和表达荧光素酶的大肠杆菌脓毒症模型,结合全身成像、流式细胞术与单细胞 RNA 测序,识别肝脏中增多的 F4/80+ 和 CD11b+ IL-27 产生细胞

基本信息
资源简介
革兰阴性新生儿脓毒症中产白细胞介素-27细胞在肝脏呈现多样表型与功能
Interleukin-27-Producing Cells in Gram-negative Neonatal Sepsis Display Diverse Phenotypes and Functions in the Liver
该数据集来自 NCBI GEO(GSE283847),包含 1 个文件(GSE283847_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱技术,物种为小鼠(10090),平台为 GPL30172。研究聚焦革兰阴性新生儿细菌性脓毒症中产 IL-27 细胞的表型与功能,利用 IL-27p28eGFP 报告小鼠和表达荧光素酶的大肠杆菌脓毒症模型,结合全身成像、流式细胞术与单细胞 RNA 测序,识别肝脏中增多的 F4/80+ 和 CD11b+ IL-27 产生细胞。数据可用于探索新生儿脓毒症肝脏免疫细胞异质性及 IL-27 相关功能研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):新生儿由于独特的免疫景观而对危及生命的感染具有更高的易感性。白细胞介素(IL)-27 是这一免疫特征的关键组成部分,我们此前已证明其在新生儿人类和小鼠中均升高。在革兰阴性新生儿细菌性脓毒症期间,IL-27 在血清和组织中持续升高,与不良结局一致。目前,我们在先前建立的表达荧光素酶的大肠杆菌脓毒症模型中,使用 IL-27p28eGFP 报告小鼠在单细胞水平上剖析了 IL-27 产生者谱。全身动物成像通过细菌发光在区域上突出显示了脾、肝和肺作为关键感染部位。流式细胞术显示,IL-27 产生者在感染后于肝脏中增加,且主要为 F4/80+ 和 CD11b+。这一信息与单细胞 RNA 测序相结合,进一步鉴定了
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL30172、10090。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE283847
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
新生儿由于独特的免疫景观,对危及生命的感染易感性增加。白细胞介素(IL)-27是该免疫特征的关键组成部分,我们此前已证明其在新生儿人类和小鼠中均升高。在革兰阴性新生儿细菌性脓毒症期间,IL-27在血清和组织中持续升高,与不良预后一致。在本研究中,我们利用IL-27p28eGFP报告小鼠,在我们先前建立的表达荧光素酶的大肠杆菌脓毒症模型中,在单细胞水平上剖析了IL-27产生细胞谱。全动物成像通过细菌发光在区域上突出显示了脾脏、肝脏和肺部作为关键感染部位。流式细胞术显示,感染后肝脏中IL-27产生细胞增加,且主要为F4/80+和CD11b+。这一信息结合单细胞RNA测序进一步确定最显著的细胞群为单核细胞及其衍生细胞、中性粒细胞和Kupffer细胞。转录组表明,一些细胞群的杀菌、代谢和炎症活性增加,而另一些则活性降低。
脓毒症是一种以极度免疫失调为特征的疾病,类似于我们细胞中所显示的情况。感染动物肝脏中IL-27产生细胞的表型和转录组提示其具有抑制活性,这促成了脓毒症中所观察到的失调免疫环境。总之,这项工作为生命早期全身性感染期间IL-27产生细胞的细节提供了此前未描述的见解。这进一步为支持将IL-27作为新生儿细菌性脓毒症的治疗靶点提供了关键信息。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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