急性肺损伤后募集肺泡巨噬细胞产生Activin-A加剧肺纤维化

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280364

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数据说明

背景：急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是一个复杂的病理级联过程，涉及过度的肺部炎症和肺泡上皮细胞凋亡，导致呼吸功能障碍和衰竭。部分ARDS可进展为更严重的肺纤维化状态，称为损伤后肺纤维化。当ARDS导致持续的肺泡和间质纤维化时，其死亡率和发病率尤其高，需要紧急治疗和适当管理。脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）小鼠模型已被广泛用于研究人类ARDS。在此，我们发现在该小鼠模型中肺泡巨噬细胞（AM）谱发生了改变。具体而言，由优势募集的AMs（recAMs）产生的激活素-A被发现与损伤后肺纤维化的进程有关。方法：通过气管内给予3.5mg/kg LPS在C57BL/6小鼠中建立ALI动物模型。采用单细胞RNA（scRNA）测序对肺巨噬细胞进行详细分类和功能表征。

体内实验中，我们利用ELISA（酶联免疫吸附试验）、组织学染色方法和免疫荧光，在ALI小鼠模型中评估了激活素A在损伤后肺纤维化中的作用。体外实验中，我们利用蛋白质印迹（WB）、qPCR（定量实时PCR）、RNA-seq（RNA测序）和免疫荧光，分析了激活素A对MLE-12细胞和骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）的影响。结果：我们的研究结果显示，在ALI情况下，recAMs取代组织驻留肺泡巨噬细胞（TRAMs）成为优势巨噬细胞群体。GO（基因本体论）分析结果表明，激活素A与伤口愈合及SMAD（ mothers against decapentaplegic抑制因子）蛋白信号通路相关。免疫荧光结果显示，激活素A的受体主要定位于肺泡

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。