IFN/STAT1/CYBB轴定义烟曲霉感染小鼠保护性pDC与中性粒细胞互作[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280164

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

烟曲霉是侵袭性曲霉病（IA）最常见的病因，这是一种在免疫功能低下患者中极具破坏性的感染。浆细胞样树突状细胞（pDCs）通过增强肺部中性粒细胞的抗真菌特性来调控宿主对IA的防御。在此，我们明确了烟曲霉感染期间pDC的活化轨迹以及构成保护性pDC-中性粒细胞交互作用的分子事件。真菌诱导的pDC活化始于骨髓外迁之后，并导致pDC依赖性的肺部I型和III型干扰素水平调控。这些pDC来源的产物作用于表达I型和III型干扰素受体的中性粒细胞，并以细胞内在方式通过STAT1信号调控中性粒细胞的杀真菌活性和活性氧产生。在机制上，中性粒细胞STAT1信号调控Cybb的转录和表达，该基因编码五种NADPH氧化酶亚基之一。因此，pDCs通过控制肺部功能性NADPH氧化酶组装和活性所需亚基的局部表达，来调控针对吸入性霉菌的灭菌性免疫。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。